Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm2aP59997 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm2aP59997 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms