Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox2P48432 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms