Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd4P46935 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms