Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa10P31310 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa10P31310 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms