Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp1P29452 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp1P29452 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp1P29452 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp1P29452 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms