Protein–RNA interactions for Protein: P28650

Adssl1, Adenylosuccinate synthetase isozyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adssl1P28650 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Adssl1P28650 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Adssl1P28650 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms