Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NelfeP19426 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NelfeP19426 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NelfeP19426 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NelfeP19426 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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