Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lama1P19137 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lama1P19137 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lama1P19137 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lama1P19137 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama1P19137 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms