Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpraP18052 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpraP18052 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpraP18052 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpraP18052 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpraP18052 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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