Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrm1P12657 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrm1P12657 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms