Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms