Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NclP09405 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NclP09405 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NclP09405 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NclP09405 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NclP09405 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NclP09405 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NclP09405 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NclP09405 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NclP09405 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NclP09405 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NclP09405 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NclP09405 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NclP09405 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NclP09405 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NclP09405 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NclP09405 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NclP09405 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NclP09405 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NclP09405 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NclP09405 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NclP09405 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NclP09405 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NclP09405 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NclP09405 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NclP09405 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NclP09405 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NclP09405 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NclP09405 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NclP09405 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NclP09405 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NclP09405 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NclP09405 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NclP09405 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NclP09405 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NclP09405 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NclP09405 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NclP09405 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NclP09405 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NclP09405 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NclP09405 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NclP09405 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NclP09405 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NclP09405 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NclP09405 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NclP09405 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NclP09405 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NclP09405 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NclP09405 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NclP09405 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NclP09405 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NclP09405 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NclP09405 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NclP09405 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NclP09405 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NclP09405 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NclP09405 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NclP09405 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NclP09405 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NclP09405 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NclP09405 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms