Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tcrg-V1P06325 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms