Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sypl2O89104 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl2O89104 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl2O89104 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl2O89104 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms