Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc4a4O88343 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc4a4O88343 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168 ms