Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8356J3QPD3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms