Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn34c3J3QJW5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c3J3QJW5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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