Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20828J3KMI7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms