Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r194J3JS27 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r194J3JS27 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms