Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rfx7F8VPJ6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rfx7F8VPJ6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rfx7F8VPJ6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms