Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r35E9Q7U8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r35E9Q7U8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms