Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80eA0A0U1RP99 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms