Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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