Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700019A02RikA0A087WPV9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms