Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pf4Q9Z126 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pf4Q9Z126 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms