Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Nup160Q9Z0W3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nup160Q9Z0W3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms