Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Trpc3Q9QZC1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Trpc3Q9QZC1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Trpc3Q9QZC1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Trpc3Q9QZC1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Trpc3Q9QZC1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc3Q9QZC1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Trpc3Q9QZC1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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Trpc3Q9QZC1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Trpc3Q9QZC1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Trpc3Q9QZC1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Trpc3Q9QZC1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Trpc3Q9QZC1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Trpc3Q9QZC1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc3Q9QZC1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Trpc3Q9QZC1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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