Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN5

Prl3c1, Prolactin-3C1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3c1Q9QUN5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prl3c1Q9QUN5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms