Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3glb1Q9JK48 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms