Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl28Q9JIL2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms