Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2b2Q9JID9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2b2Q9JID9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms