Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfcp2Q9ERA0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfcp2Q9ERA0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms