Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpbpQ9EQI5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpbpQ9EQI5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpbpQ9EQI5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms