Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmg20aQ9DC33 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmg20aQ9DC33 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmg20aQ9DC33 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms