Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms