Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms