Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slx4ipQ9D7Y9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4ipQ9D7Y9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slx4ipQ9D7Y9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms