Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap5s1Q9D742 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap5s1Q9D742 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms