Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fsip1Q9D3V5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms