Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx20Q9D2Y5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms