Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spns3Q9D232 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spns3Q9D232 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spns3Q9D232 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms