Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CR55 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CR55 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CR55 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CR55 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CR55 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CR55 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CR55 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CR55 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CR55 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CR55 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CR55 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CR55 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CR55 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CR55 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CR55 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CR55 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CR55 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms