Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid1ip1Q9CQ20 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid1ip1Q9CQ20 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid1ip1Q9CQ20 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid1ip1Q9CQ20 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid1ip1Q9CQ20 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms