Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim3Q99PE5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim3Q99PE5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms