Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsnaxip1Q99P25 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms