Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl27Q99N92 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl27Q99N92 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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