Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TriobpQ99KW3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TriobpQ99KW3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TriobpQ99KW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TriobpQ99KW3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TriobpQ99KW3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TriobpQ99KW3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TriobpQ99KW3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TriobpQ99KW3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TriobpQ99KW3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms