Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlgn1Q99K10 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlgn1Q99K10 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms