Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sntg1Q925E1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms