Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp4Q8VHC5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cabp4Q8VHC5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cabp4Q8VHC5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms